ヒトiPS細胞由来呼吸器オルガノイドを用いたRSウイルス感染症研究

• ヒト呼吸器オルガノイドにRSウイルスは効率よく感染しました。
• RSウイルスに感染したヒト呼吸器オルガノイドにおいて、呼吸器上皮層の破壊、自然免疫応答、炎症応答を観察できました。
• ヒト呼吸器オルガノイドを用いて、RSウイルスの治療薬および予防薬を評価できました。

橋本里菜研究員（京都大学 CiRA増殖分化機構研究部門・研究当時、現・東京科学大学 総合研究院 難治疾患研究所）、高山和雄講師（京都大学 CiRA同部門・研究当時、現・東京科学大学 同研究所）、渡邉幸夫研究員（京都大学 CiRA同部門・研究当時）らの研究チームは、ヒトiPS細胞より分化誘導した呼吸器オルガノイドを用いて、RSウイルス感染時における宿主応答を解析しました。また、ヒト呼吸器オルガノイド^[用語1]を用いてRSウイルスに対するモノクローナル抗体および米国でRSウイルス感染症の治療薬として認可されている リバビリンの抗ウイルス効果を評価しました。

研究チームが開発したヒト呼吸器オルガノイドは、呼吸器上皮細胞だけでなくマクロファージや線維芽細胞、血管内皮細胞を含んでいるため、炎症^[用語2]などをより正確に再現することができます。本研究では、RSウイルスを感染させたヒト呼吸器オルガノイドを用いて、RSウイルス感染時のヒト呼吸器における宿主応答を詳細に解析しました。また、ヒト呼吸器オルガノイドを用いてモノクローナル抗体およびリバビリンの抗ウイルス効果の比較を行いました。以上より、ヒト呼吸器オルガノイドはRSウイルス感染症病態解析および創薬研究のための有用なツールとなる可能性が示唆されました。

この研究成果は2025年4月23日に「Life Science Alliance」でオンライン公開されました。

RSウイルスは、主に乳幼児に感染し、重症化すると呼吸困難を伴う下気道炎を呈する呼吸器感染症です。患者が多いにも関わらず、RSV感染病態に対する理解は未だ限定的で、抗ウイルス薬の開発は十分ではありません。その原因として、RSV感染症モデルの確立が不十分であることがあげられます。そこで本研究では、呼吸器を構成する呼吸器上皮細胞や免疫細胞、線維芽細胞、血管内皮細胞を含むヒト呼吸器オルガノイドをRSV感染症モデルとして使用できないか検証しました。

ヒト呼吸器オルガノイドにRSウイルスを感染させ、4日間培養しました。培養上清中のウイルス力価は、経時的に増加しました（図1A）。また、感染4日後のRSウイルスmRNAおよびRSウイルス融合タンパク質（Ｆタンパク質）^[用語3]の高い発現が確認でき（図1B、1C）、電子顕微鏡によってRSウイルス粒子が観察されました（図1D）。蛍光染色画像では、アセチル化αチューブリン陽性の線毛細胞^[用語4]からなる上皮層が、RSウイルス感染により破壊される様子が確認できました（図1E）。以上の結果から、RSウイルスはヒト呼吸器オルガノイドに効率よく感染することが示唆されました。

次に、ヒト呼吸器オルガノイドにおけるRSウイルス感染時の宿主応答の解析を行いました。ヘマトキシリン・エオシン（H&E）染色およびシリウスレッド染色の結果から、RSウイルスを感染させたヒト呼吸器オルガノイドにおいて呼吸器上皮層が破壊され、コラーゲンが蓄積する様子が確認できました（図2A、2B）

RSウイルス感染ヒト呼吸器オルガノイドを用いて、RNAシーケンス解析を実施しました。その結果、RSウイルス感染により有意な発現上昇した遺伝子が381個、発現低下した遺伝子が120個確認できました（図3A）。381個の発現上昇遺伝子を用いたエンリッチメント解析より、インターフェロン（IFN）-γ応答を含む自然免疫応答や炎症応答に関与する遺伝子群の発現が上昇していることが示唆されました（図3B）。また、培養上清中に含まれるサイトカイン量を測定したところ、IFN-γやインターロイキン（IL）-8を含む多くのサイトカイン量の増加が確認できました（図3C）。以上の結果から、RSウイルスを感染させたヒト呼吸器オルガノイドにおいて、呼吸器上皮層の破壊、コラーゲンの蓄積、自然免疫応答や炎症応答が観察できることが分かりました。

最後に、ヒトRSウイルスに対するモノクローナル抗体4種（ニルセビマブ、スプタブマブ、クレスロビマブ、パリビズマブ）およびリバビリンの評価を行いました。パリビズマブは1998年に、ニルセビマブは2023年にRSウイルス感染症の予防薬として承認されたモノクローナル抗体であり、その有効性は臨床的にも認められています。一方でリバビリンはRSウイルス感染症の治療薬として用いられることもありましたが、有効性が十分ではないこと、対象患者や投与法が限定的であることなど課題がありました。これらモノクローナル抗体およびリバビリンを作用させたヒト呼吸器オルガノイドにRSウイルスを感染させ、4日後のウイルス力価を測定しました。その結果、モノクローナル抗体は作用濃度依存的にウイルス力価が減少する一方で、リバビリンは高濃度作用群においてもウイルス力価が十分に低下しませんでした（図4A）。また、ニルセビマブおよびパリビズマブを作用させたヒト呼吸器オルガノイドのシングルセルRNAシーケンス解析を行いました。その結果、I型肺胞上皮細胞やII型肺胞上皮細胞^[用語5]、線毛細胞、分泌細胞^[用語6]におけるRSウイルス核タンパク質（Nタンパク質）^[用語7]の発現量が、ニルセビマブおよびパリビズマブ作用によって有意に低下していることが分かりました（図4B）。さらに、II型肺胞上皮細胞や線毛細胞、分泌細胞における自然免疫応答関連遺伝子（ISG、IFI6）はニルセビマブおよびパリビズマブ作用によって低下していました（図4C）。以上の結果から、ヒト呼吸器オルガノイドは、RSウイルスの治療薬および予防薬の評価が可能であることが示唆されました。

• iPS細胞研究基金
• 日本医療研究開発機構（AMED）（JP21gm1610005、JP23fk0210135、JP23bm1323001、JP23jf0126002、JP243fa627001）
• 日本学術振興会（JSPS）研究拠点形成事業（A.先端拠点形成型）（JPJSCCA20240006）
• 京都大学・ウイルス感染症・生命科学先端融合的共同研究拠点

[用語1]

ヒト呼吸器オルガノイド：ヒトiPS細胞より分化誘導した呼吸器オルガノイド。気道上皮細胞および肺胞上皮細胞どちらも有しているだけでなく、肺胞マクロファージ、線維芽細胞、血管内皮細胞でも構成されている。

[用語2]

炎症：病原体の侵入や組織損傷などをきっかけに、上皮細胞あるいは血管内皮細胞、免疫細胞から炎症性サイトカイン等の放出から始まる連鎖的な免疫応答反応。炎症発生後の組織修復の過程で、活性化した線維芽細胞が細胞外マトリクスを産生する。

[用語3]

RSウイルス融合タンパク質（Fタンパク質）：RSウイルスの構造タンパク質のひとつ。宿主細胞への膜融合の際に重要な役割を果たす。

[用語4]

線毛細胞：気道上皮層を構成する細胞のひとつ。線毛をもち、異物を外に出す働きを持つ。

[用語5]

I型、II型肺胞上皮細胞：肺胞上皮層を構成する細胞。I型肺胞上皮細胞は酸素や二酸化炭素などのガス交換に重要な働きを示す。II型肺胞上皮細胞は肺がつぶれないようにする活性物質（サーファクタント）を分泌し、I型肺胞上皮細胞に分化する幹細胞としての役割をもつ。

[用語6]

分泌細胞：気道上皮層を構成する細胞のうち、粘液などを分泌する細胞の総称。

[用語7]

RSウイルス核タンパク質（Nタンパク質）：RSウイルスの非構造タンパク質のひとつ。ウイルス複製に重要な役割を果たす。

掲載誌：

Life Science Alliance

タイトル：

Human iPS cell-derived respiratory organoids as a model for respiratory syncytial virus infection

著者：

Rina Hashimoto^1,2*, Yukio Watanabe¹*, Abeer Keshta¹, Masaya Sugiyama³, Yuki Kitai⁴, Ai Hirabayashi^5,6, Naoko Yasuhara¹, Shiho Morimoto¹, Ayaka Sakamoto¹, Yasufumi Matsumura7, Hidekazu Nishimura⁸, Takeshi Noda^5,6,9, Takuya Yamamoto^1,10,11, Miki Nagao⁷, Makoto Takeda⁴, Kazuo Takayama^1,2**
*筆頭著者 **責任著者

所属

¹ 京都大学・iPS細胞研究所（CiRA）
² 東京科学大学・総合研究院難治疾患研究所・人体模倣システム学分野
³ 国立国際医療研究センター・研究所感染病態研究部
⁴ 東京大学・大学院医学系研究科・医学部・微生物学教室
⁵ 京都大学・医生物学研究所・微細構造ウイルス学分野
⁶ 科学技術振興機構・CREST
⁷ 京都大学・大学院医学研究科・臨床病態検査学
⁸ 仙台医療センター・臨床研究部・ウイルスセンター
⁹ 京都大学・大学院生命科学研究科・微細構造ウイルス学分野
¹⁰ 京都大学・ヒト生物学高等研究拠点（WPI-ASHBi）
¹¹ 理化学研究所・革新知能統合研究センター（AIP）

DOI：

10.26508/lsa.202402837

• プレスリリース ヒトiPS細胞由来呼吸器オルガノイドを用いたRSウイルス感染症研究（PDF）

• 高山 和雄 TAKAYAMA Kazuo｜Science Tokyo 研究情報データベース
• 人体模倣システム学分野
• 人体模倣システム学｜難治疾患研究所
• 総合研究院

• 京都大学iPS細胞研究所 CiRA（サイラ）